Khi còn là sinh viên, Manske là một trong những người đóng góp đầu tiên cho bách khoa toàn thư Internet Nupedia, tiền thân của Wikipedia, và sau đó đã viết một trong những phiên bản đầu tiên của phần mềm MediaWiki mà Wikipedia vận hành theo.[7] Manske từng làm việc tại Cambridge với Viện Wellcome Trust Sanger từ tháng 4 năm 2007,[8][9][10][11][12] nhưng vẫn tích cực trong việc phát triển các công cụ cho Wikipedia[13] và các dự án chị em của nó là Wikidata và Wikimedia Commons.[14]

Năm 2012, Manske là đồng tác giả của một bài báo khoa học được xuất bản trên tạp chí Nature trình bày những cách mới để xác định các khu vực mà ký sinh trùng sốt rét đang phát triển và mô tả các kỹ thuật lập bản đồ kháng thuốc sốt rét. Các nhà nghiên cứu đã phát triển một kỹ thuật để chiết xuất DNA của ký sinh trùng sốt rét trực tiếp từ máu, giúp giảm thiểu sai sót trong công đoạn giải trình tự.[8][15]

Manske được công nhận là người tạo ra bài viết đầu tiên trên Wikipedia tiếng Đức, về phản ứng chuỗi polymerase, do chính ông khởi tạo vào năm 2001.[16][17][18]